В случае одновременной смерти всех владельцев квартиры, в действие вступает наследстенное право и оставшиеся наследники, если они есть, вступая в наследство принимают все права и обязанности, в том числе обязательства по погашению кредита. Если наследников нет, в права наследования вступает государство в лице соответствующей налоговой, квартира будет реализована для погашения кредита перед банком, а разница будет зачтена в доход государства.
В отношение того, что банк забирает правоустанавливающие документы можно сказать следующее: в принципе банк не имеет право это делать, но некоторые банки продолжают это делать, хотя никакой дополнительной безопасности для банка здесь не возникает. В любой момент вы можете получить дубликаты своих правоустанавливающих документов и банк об этом не узнает. Соответственно и рисков для вас никаких нет. А если что-то смущает - ищите банк, который документов не забирает. Банков, которые документов не забирают сейчас большинство.